Si vous avez effectué des modifications locales sur le fichier /etc/suphp/suphp.conf et que vous n'avez pas été très vigilant lors de la mise à jour vers Lenny vous pouvez vous retrouver avec de genre d'erreurs dans votre log apache:

[Xxx Xxx xx xx:xx:xx xxxx] [error] [client xxx.xxx.xxx.xxx] SecurityException in Application.cpp:440: Handler not found in configuration
[Xxx Xxx xx xx:xx:xx xxxx] [error] [client xxx.xxx.xxx.xxx] Caused by KeyNotFoundException in Configuration.cpp:234: Handler "application/x-httpd-php" not found
[Xxx Xxx xx xx:xx:xx xxxx] [error] [client xxx.xxx.xxx.xxx] Premature end of script headers: xxxxx.php

Cela vient du fait que pour des raisons de sécurité, on est passé d'un AddHandler x-httpd-php à un AddType application/x-httpd-php. Du coup il faut mettre à jour la section [handlers] du fichier suphp.conf:

x-httpd-php=php:/usr/bin/php-cgi

devient

application/x-httpd-php=php:/usr/bin/php-cgi

Et le tour et joué (même pas besoin de redémarrer Apache)